Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SFT2D3Q587I9 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SFT2D3Q587I9 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SFT2D3Q587I9 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SFT2D3Q587I9 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SFT2D3Q587I9 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SFT2D3Q587I9 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SFT2D3Q587I9 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SFT2D3Q587I9 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SFT2D3Q587I9 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SFT2D3Q587I9 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SFT2D3Q587I9 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SFT2D3Q587I9 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SFT2D3Q587I9 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SFT2D3Q587I9 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SFT2D3Q587I9 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SFT2D3Q587I9 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SFT2D3Q587I9 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SFT2D3Q587I9 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SFT2D3Q587I9 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SFT2D3Q587I9 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SFT2D3Q587I9 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SFT2D3Q587I9 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SFT2D3Q587I9 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SFT2D3Q587I9 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SFT2D3Q587I9 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SFT2D3Q587I9 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SFT2D3Q587I9 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SFT2D3Q587I9 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SFT2D3Q587I9 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SFT2D3Q587I9 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SFT2D3Q587I9 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SFT2D3Q587I9 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SFT2D3Q587I9 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SFT2D3Q587I9 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SFT2D3Q587I9 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SFT2D3Q587I9 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SFT2D3Q587I9 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SFT2D3Q587I9 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SFT2D3Q587I9 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SFT2D3Q587I9 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SFT2D3Q587I9 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SFT2D3Q587I9 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SFT2D3Q587I9 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SFT2D3Q587I9 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SFT2D3Q587I9 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SFT2D3Q587I9 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SFT2D3Q587I9 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SFT2D3Q587I9 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SFT2D3Q587I9 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SFT2D3Q587I9 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SFT2D3Q587I9 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SFT2D3Q587I9 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SFT2D3Q587I9 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SFT2D3Q587I9 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SFT2D3Q587I9 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SFT2D3Q587I9 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.2 ms