Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 Z99774.1-201ENST00000382641 2613 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 CRYBG1-201ENST00000369066 7553 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 COL6A3-202ENST00000347401 8625 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 COL6A3-209ENST00000472056 8628 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 MKNK1-203ENST00000371945 2618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 LINC02048-201ENST00000440556 1771 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
HSD17B12Q53GQ0 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
HSD17B12Q53GQ0 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
HSD17B12Q53GQ0 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HSD17B12Q53GQ0 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
HSD17B12Q53GQ0 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
HSD17B12Q53GQ0 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
HSD17B12Q53GQ0 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
HSD17B12Q53GQ0 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HSD17B12Q53GQ0 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
HSD17B12Q53GQ0 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HSD17B12Q53GQ0 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HSD17B12Q53GQ0 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HSD17B12Q53GQ0 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HSD17B12Q53GQ0 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HSD17B12Q53GQ0 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HSD17B12Q53GQ0 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
HSD17B12Q53GQ0 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HSD17B12Q53GQ0 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
HSD17B12Q53GQ0 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HSD17B12Q53GQ0 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HSD17B12Q53GQ0 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
HSD17B12Q53GQ0 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
HSD17B12Q53GQ0 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HSD17B12Q53GQ0 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HSD17B12Q53GQ0 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
HSD17B12Q53GQ0 ANKRD11-201ENST00000301030 9301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HSD17B12Q53GQ0 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
HSD17B12Q53GQ0 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HSD17B12Q53GQ0 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
HSD17B12Q53GQ0 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HSD17B12Q53GQ0 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
HSD17B12Q53GQ0 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
HSD17B12Q53GQ0 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
HSD17B12Q53GQ0 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HSD17B12Q53GQ0 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HSD17B12Q53GQ0 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HSD17B12Q53GQ0 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HSD17B12Q53GQ0 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HSD17B12Q53GQ0 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HSD17B12Q53GQ0 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HSD17B12Q53GQ0 GRM5-AS1-201ENST00000526448 4821 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HSD17B12Q53GQ0 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HSD17B12Q53GQ0 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HSD17B12Q53GQ0 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HSD17B12Q53GQ0 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HSD17B12Q53GQ0 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HSD17B12Q53GQ0 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HSD17B12Q53GQ0 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HSD17B12Q53GQ0 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HSD17B12Q53GQ0 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HSD17B12Q53GQ0 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HSD17B12Q53GQ0 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
HSD17B12Q53GQ0 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HSD17B12Q53GQ0 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HSD17B12Q53GQ0 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HSD17B12Q53GQ0 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
HSD17B12Q53GQ0 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HSD17B12Q53GQ0 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HSD17B12Q53GQ0 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HSD17B12Q53GQ0 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HSD17B12Q53GQ0 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HSD17B12Q53GQ0 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
HSD17B12Q53GQ0 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HSD17B12Q53GQ0 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
HSD17B12Q53GQ0 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms