Protein–RNA interactions for Protein: Q16832

DDR2, Discoidin domain-containing receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 855 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR2Q16832 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
DDR2Q16832 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DDR2Q16832 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DDR2Q16832 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DDR2Q16832 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DDR2Q16832 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DDR2Q16832 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DDR2Q16832 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DDR2Q16832 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DDR2Q16832 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DDR2Q16832 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DDR2Q16832 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DDR2Q16832 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DDR2Q16832 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DDR2Q16832 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DDR2Q16832 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
DDR2Q16832 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
DDR2Q16832 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DDR2Q16832 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
DDR2Q16832 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DDR2Q16832 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
DDR2Q16832 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DDR2Q16832 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DDR2Q16832 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DDR2Q16832 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DDR2Q16832 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DDR2Q16832 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DDR2Q16832 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DDR2Q16832 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DDR2Q16832 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DDR2Q16832 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DDR2Q16832 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DDR2Q16832 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DDR2Q16832 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DDR2Q16832 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DDR2Q16832 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DDR2Q16832 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DDR2Q16832 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DDR2Q16832 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
DDR2Q16832 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DDR2Q16832 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DDR2Q16832 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DDR2Q16832 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DDR2Q16832 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DDR2Q16832 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DDR2Q16832 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DDR2Q16832 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DDR2Q16832 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DDR2Q16832 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DDR2Q16832 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DDR2Q16832 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DDR2Q16832 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
DDR2Q16832 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DDR2Q16832 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
DDR2Q16832 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DDR2Q16832 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DDR2Q16832 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DDR2Q16832 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DDR2Q16832 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DDR2Q16832 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DDR2Q16832 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DDR2Q16832 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DDR2Q16832 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DDR2Q16832 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DDR2Q16832 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DDR2Q16832 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DDR2Q16832 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
DDR2Q16832 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
DDR2Q16832 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DDR2Q16832 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DDR2Q16832 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
DDR2Q16832 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DDR2Q16832 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DDR2Q16832 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DDR2Q16832 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DDR2Q16832 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DDR2Q16832 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DDR2Q16832 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DDR2Q16832 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DDR2Q16832 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DDR2Q16832 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DDR2Q16832 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
DDR2Q16832 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
DDR2Q16832 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DDR2Q16832 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DDR2Q16832 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DDR2Q16832 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DDR2Q16832 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DDR2Q16832 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DDR2Q16832 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DDR2Q16832 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DDR2Q16832 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DDR2Q16832 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DDR2Q16832 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DDR2Q16832 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DDR2Q16832 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DDR2Q16832 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DDR2Q16832 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
DDR2Q16832 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
DDR2Q16832 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms