Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPROQ16827 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPROQ16827 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPROQ16827 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPROQ16827 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPROQ16827 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPROQ16827 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPROQ16827 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPROQ16827 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPROQ16827 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPROQ16827 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPROQ16827 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPROQ16827 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPROQ16827 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPROQ16827 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPROQ16827 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPROQ16827 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPROQ16827 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPROQ16827 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPROQ16827 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPROQ16827 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPROQ16827 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPROQ16827 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPROQ16827 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPROQ16827 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPROQ16827 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPROQ16827 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPROQ16827 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPROQ16827 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPROQ16827 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPROQ16827 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTPROQ16827 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPROQ16827 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPROQ16827 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPROQ16827 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPROQ16827 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPROQ16827 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPROQ16827 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPROQ16827 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPROQ16827 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPROQ16827 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPROQ16827 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPROQ16827 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPROQ16827 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPROQ16827 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPROQ16827 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPROQ16827 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPROQ16827 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPROQ16827 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPROQ16827 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPROQ16827 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPROQ16827 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPROQ16827 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPROQ16827 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPROQ16827 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPROQ16827 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPROQ16827 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
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PTPROQ16827 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPROQ16827 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPROQ16827 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPROQ16827 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPROQ16827 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPROQ16827 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
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PTPROQ16827 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPROQ16827 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPROQ16827 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPROQ16827 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPROQ16827 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPROQ16827 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPROQ16827 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPROQ16827 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPROQ16827 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPROQ16827 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPROQ16827 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPROQ16827 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTPROQ16827 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPROQ16827 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPROQ16827 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPROQ16827 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPROQ16827 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPROQ16827 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPROQ16827 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPROQ16827 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPROQ16827 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPROQ16827 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPROQ16827 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPROQ16827 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPROQ16827 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPROQ16827 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPROQ16827 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPROQ16827 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPROQ16827 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPROQ16827 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPROQ16827 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPROQ16827 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPROQ16827 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PTPROQ16827 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
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