Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GRIK4Q16099 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
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