Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIP13Q15645 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms