Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 AC084752.1-201ENST00000509766 622 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
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CDSNQ15517 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
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CDSNQ15517 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
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CDSNQ15517 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
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CDSNQ15517 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CDSNQ15517 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
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