Protein–RNA interactions for Protein: Q15404

RSU1, Ras suppressor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSU1Q15404 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RSU1Q15404 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
RSU1Q15404 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RSU1Q15404 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RSU1Q15404 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
RSU1Q15404 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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RSU1Q15404 CX3CL1-204ENST00000565912 5796 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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RSU1Q15404 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RSU1Q15404 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RSU1Q15404 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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RSU1Q15404 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
RSU1Q15404 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
RSU1Q15404 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RSU1Q15404 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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RSU1Q15404 TRIM56-201ENST00000306085 10952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RSU1Q15404 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
RSU1Q15404 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RSU1Q15404 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
RSU1Q15404 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RSU1Q15404 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
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RSU1Q15404 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RSU1Q15404 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
RSU1Q15404 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RSU1Q15404 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RSU1Q15404 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
RSU1Q15404 CRYBG1-201ENST00000369066 7553 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RSU1Q15404 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RSU1Q15404 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
RSU1Q15404 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
RSU1Q15404 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
RSU1Q15404 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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RSU1Q15404 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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RSU1Q15404 ARHGEF17-201ENST00000263674 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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RSU1Q15404 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
RSU1Q15404 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
RSU1Q15404 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RSU1Q15404 USP49-203ENST00000394253 9034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
RSU1Q15404 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RSU1Q15404 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
RSU1Q15404 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RSU1Q15404 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
RSU1Q15404 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RSU1Q15404 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RSU1Q15404 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
RSU1Q15404 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RSU1Q15404 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
RSU1Q15404 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RSU1Q15404 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RSU1Q15404 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RSU1Q15404 HIPK3-202ENST00000379016 7345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RSU1Q15404 MAPKAPK5-206ENST00000550735 11349 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RSU1Q15404 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RSU1Q15404 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RSU1Q15404 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
RSU1Q15404 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
RSU1Q15404 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RSU1Q15404 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
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