Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

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Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
PCOLCEQ15113 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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