Protein–RNA interactions for Protein: Q14957

GRIN2C, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, humanhuman

Predictions only

Length 1,233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2CQ14957 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIN2CQ14957 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIN2CQ14957 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIN2CQ14957 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIN2CQ14957 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIN2CQ14957 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIN2CQ14957 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIN2CQ14957 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIN2CQ14957 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GRIN2CQ14957 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIN2CQ14957 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIN2CQ14957 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIN2CQ14957 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIN2CQ14957 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIN2CQ14957 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIN2CQ14957 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIN2CQ14957 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIN2CQ14957 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIN2CQ14957 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIN2CQ14957 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIN2CQ14957 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIN2CQ14957 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIN2CQ14957 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIN2CQ14957 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIN2CQ14957 HDAC8-204ENST00000373560 819 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIN2CQ14957 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIN2CQ14957 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIN2CQ14957 AC004522.1-201ENST00000419978 654 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIN2CQ14957 FAM92A-202ENST00000423990 914 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIN2CQ14957 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIN2CQ14957 TAGLN3-203ENST00000455401 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIN2CQ14957 OCEL1-206ENST00000597836 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIN2CQ14957 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIN2CQ14957 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIN2CQ14957 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIN2CQ14957 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIN2CQ14957 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIN2CQ14957 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIN2CQ14957 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIN2CQ14957 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIN2CQ14957 AC021305.1-201ENST00000520656 1514 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIN2CQ14957 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIN2CQ14957 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIN2CQ14957 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIN2CQ14957 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIN2CQ14957 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIN2CQ14957 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIN2CQ14957 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIN2CQ14957 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIN2CQ14957 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIN2CQ14957 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIN2CQ14957 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GRIN2CQ14957 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIN2CQ14957 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIN2CQ14957 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIN2CQ14957 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIN2CQ14957 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIN2CQ14957 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIN2CQ14957 PSTPIP1-207ENST00000559295 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIN2CQ14957 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIN2CQ14957 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIN2CQ14957 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIN2CQ14957 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIN2CQ14957 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIN2CQ14957 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIN2CQ14957 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIN2CQ14957 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIN2CQ14957 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIN2CQ14957 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIN2CQ14957 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIN2CQ14957 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIN2CQ14957 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIN2CQ14957 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIN2CQ14957 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIN2CQ14957 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIN2CQ14957 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIN2CQ14957 RPL35P9-201ENST00000446059 350 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIN2CQ14957 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIN2CQ14957 BANF1-205ENST00000527348 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIN2CQ14957 TGFB3-204ENST00000556285 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIN2CQ14957 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIN2CQ14957 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIN2CQ14957 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIN2CQ14957 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIN2CQ14957 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIN2CQ14957 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIN2CQ14957 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIN2CQ14957 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIN2CQ14957 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIN2CQ14957 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIN2CQ14957 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GRIN2CQ14957 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
GRIN2CQ14957 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
GRIN2CQ14957 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GRIN2CQ14957 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GRIN2CQ14957 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GRIN2CQ14957 CCL18-201ENST00000616054 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GRIN2CQ14957 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GRIN2CQ14957 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GRIN2CQ14957 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms