Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 IFT57-201ENST00000264538 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
APOFQ13790 NLRP7-207ENST00000590030 3209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
APOFQ13790 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
APOFQ13790 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
APOFQ13790 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
APOFQ13790 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
APOFQ13790 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
APOFQ13790 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
APOFQ13790 EPN2-205ENST00000395626 2863 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
APOFQ13790 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
APOFQ13790 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
APOFQ13790 ALOX15B-202ENST00000380183 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
APOFQ13790 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
APOFQ13790 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
APOFQ13790 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
APOFQ13790 ELN-209ENST00000380576 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
APOFQ13790 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
APOFQ13790 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
APOFQ13790 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
APOFQ13790 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
APOFQ13790 ICOSLG-202ENST00000400377 2907 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
APOFQ13790 CAMKV-209ENST00000477224 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
APOFQ13790 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
APOFQ13790 SLC5A9-210ENST00000533824 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
APOFQ13790 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
APOFQ13790 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
APOFQ13790 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
APOFQ13790 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
APOFQ13790 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
APOFQ13790 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
APOFQ13790 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
APOFQ13790 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
APOFQ13790 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
APOFQ13790 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
APOFQ13790 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
APOFQ13790 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
APOFQ13790 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
APOFQ13790 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
APOFQ13790 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
APOFQ13790 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
APOFQ13790 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
APOFQ13790 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
APOFQ13790 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
APOFQ13790 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
APOFQ13790 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
APOFQ13790 ADGRG3-201ENST00000333493 2728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
APOFQ13790 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
APOFQ13790 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
APOFQ13790 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
APOFQ13790 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
APOFQ13790 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
APOFQ13790 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
APOFQ13790 CAMKV-215ENST00000488336 2905 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
APOFQ13790 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
APOFQ13790 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
APOFQ13790 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
APOFQ13790 CYP4F11-204ENST00000591841 2531 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
APOFQ13790 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
APOFQ13790 BIRC5-202ENST00000350051 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
APOFQ13790 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
APOFQ13790 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
APOFQ13790 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
APOFQ13790 PTH2R-201ENST00000272847 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
APOFQ13790 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
APOFQ13790 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
APOFQ13790 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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APOFQ13790 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
APOFQ13790 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
APOFQ13790 CARHSP1-217ENST00000611932 2833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
APOFQ13790 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
APOFQ13790 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
APOFQ13790 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
APOFQ13790 DDX43-201ENST00000370336 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
APOFQ13790 LARP7-202ENST00000344442 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
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APOFQ13790 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
APOFQ13790 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
APOFQ13790 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
APOFQ13790 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
APOFQ13790 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
APOFQ13790 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
APOFQ13790 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
APOFQ13790 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
APOFQ13790 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
APOFQ13790 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
APOFQ13790 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
APOFQ13790 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
APOFQ13790 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
APOFQ13790 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
APOFQ13790 OTP-201ENST00000306422 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
APOFQ13790 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
APOFQ13790 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
APOFQ13790 NRROS-201ENST00000328557 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
APOFQ13790 XIRP1-203ENST00000421646 2596 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
APOFQ13790 CAMSAP3-201ENST00000160298 3889 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
APOFQ13790 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
APOFQ13790 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
APOFQ13790 AP000437.1-201ENST00000624057 2085 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
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