Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 SULT2A1-201ENST00000222002 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC11.43□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC11.43□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms