Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GRIK3Q13003 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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