Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CNTN1Q12860 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CNTN1Q12860 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CNTN1Q12860 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CNTN1Q12860 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CNTN1Q12860 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CNTN1Q12860 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CNTN1Q12860 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CNTN1Q12860 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CNTN1Q12860 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CNTN1Q12860 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CNTN1Q12860 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CNTN1Q12860 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CNTN1Q12860 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CNTN1Q12860 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CNTN1Q12860 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CNTN1Q12860 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CNTN1Q12860 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CNTN1Q12860 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
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CNTN1Q12860 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
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CNTN1Q12860 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CNTN1Q12860 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CNTN1Q12860 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CNTN1Q12860 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
CNTN1Q12860 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CNTN1Q12860 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CNTN1Q12860 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
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CNTN1Q12860 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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CNTN1Q12860 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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CNTN1Q12860 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CNTN1Q12860 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CNTN1Q12860 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CNTN1Q12860 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CNTN1Q12860 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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CNTN1Q12860 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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CNTN1Q12860 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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CNTN1Q12860 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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CNTN1Q12860 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CNTN1Q12860 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CNTN1Q12860 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CNTN1Q12860 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
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CNTN1Q12860 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CNTN1Q12860 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
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CNTN1Q12860 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
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CNTN1Q12860 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CNTN1Q12860 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CNTN1Q12860 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CNTN1Q12860 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CNTN1Q12860 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CNTN1Q12860 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CNTN1Q12860 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
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