Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 ELAVL1-201ENST00000407627 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 PROKR1-201ENST00000303786 4273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 CACNA1G-230ENST00000514717 6699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 ITPR2-202ENST00000381340 11405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 APAF1-202ENST00000357310 7055 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 PRKAR1A-203ENST00000392711 4327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 OR2C3-204ENST00000641802 8509 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 AP1B1-201ENST00000317368 3903 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 OTUD4-201ENST00000447906 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 IRS1-201ENST00000305123 9705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 GOPC-202ENST00000368498 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 MAP7-202ENST00000432797 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 SON-203ENST00000381679 7860 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 SATB2-201ENST00000260926 5318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 LINC02048-201ENST00000440556 1771 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 FRMD4B-201ENST00000398540 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 BDKRB2-202ENST00000542454 6845 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 GOLGA7B-203ENST00000596005 6378 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 AFF3-201ENST00000317233 8135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFFO1Q0D2I5 WIZ-202ENST00000389282 4067 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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