Protein–RNA interactions for Protein: Q09470

KCNA1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA1Q09470 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 SULT2A1-201ENST00000222002 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 HCG24-202ENST00000414398 717 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNA1Q09470 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms