Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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FAM3AP98173 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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FAM3AP98173 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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FAM3AP98173 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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FAM3AP98173 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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FAM3AP98173 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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FAM3AP98173 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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FAM3AP98173 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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FAM3AP98173 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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FAM3AP98173 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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FAM3AP98173 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
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FAM3AP98173 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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FAM3AP98173 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FAM3AP98173 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
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