Protein–RNA interactions for Protein: P84550

SKOR1, SKI family transcriptional corepressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR1P84550 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SKOR1P84550 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SKOR1P84550 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SKOR1P84550 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SKOR1P84550 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SKOR1P84550 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SKOR1P84550 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SKOR1P84550 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SKOR1P84550 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SKOR1P84550 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SKOR1P84550 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SKOR1P84550 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SKOR1P84550 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SKOR1P84550 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SKOR1P84550 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SKOR1P84550 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SKOR1P84550 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SKOR1P84550 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SKOR1P84550 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SKOR1P84550 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SKOR1P84550 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SKOR1P84550 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SKOR1P84550 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SKOR1P84550 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SKOR1P84550 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SKOR1P84550 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SKOR1P84550 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SKOR1P84550 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SKOR1P84550 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SKOR1P84550 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SKOR1P84550 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SKOR1P84550 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SKOR1P84550 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SKOR1P84550 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SKOR1P84550 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SKOR1P84550 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SKOR1P84550 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SKOR1P84550 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SKOR1P84550 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SKOR1P84550 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SKOR1P84550 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKOR1P84550 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKOR1P84550 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKOR1P84550 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKOR1P84550 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKOR1P84550 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKOR1P84550 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKOR1P84550 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKOR1P84550 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKOR1P84550 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKOR1P84550 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKOR1P84550 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SKOR1P84550 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKOR1P84550 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKOR1P84550 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKOR1P84550 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKOR1P84550 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKOR1P84550 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKOR1P84550 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKOR1P84550 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKOR1P84550 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKOR1P84550 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKOR1P84550 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKOR1P84550 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKOR1P84550 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SKOR1P84550 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKOR1P84550 AC073575.1-201ENST00000551125 596 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKOR1P84550 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKOR1P84550 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKOR1P84550 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SKOR1P84550 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SKOR1P84550 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKOR1P84550 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKOR1P84550 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKOR1P84550 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKOR1P84550 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKOR1P84550 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKOR1P84550 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKOR1P84550 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKOR1P84550 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKOR1P84550 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKOR1P84550 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKOR1P84550 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SKOR1P84550 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKOR1P84550 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKOR1P84550 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKOR1P84550 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKOR1P84550 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKOR1P84550 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKOR1P84550 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKOR1P84550 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKOR1P84550 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKOR1P84550 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKOR1P84550 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKOR1P84550 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKOR1P84550 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKOR1P84550 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKOR1P84550 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKOR1P84550 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SKOR1P84550 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms