Protein–RNA interactions for Protein: P84022

SMAD3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3P84022 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 SERBP1P2-201ENST00000436888 1164 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 SH3BGR-209ENST00000458295 812 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 PRRC2B-207ENST00000458550 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 FXYD6-FXYD2-201ENST00000532984 670 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 LINC01569-203ENST00000573268 694 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 AC055811.3-201ENST00000584952 686 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 FTLP5-201ENST00000586853 534 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 PROK2-201ENST00000295619 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 GDPGP1-201ENST00000329600 1193 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 HNRNPA1P58-201ENST00000403629 610 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 LINC01278-201ENST00000433061 529 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 ROPN1B-203ENST00000505382 713 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 LINC01278-206ENST00000610088 554 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 AC106774.7-201ENST00000638408 597 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 AC106774.6-201ENST00000638483 597 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 AC233724.20-201ENST00000638842 597 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 AC233724.19-201ENST00000639969 597 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 AC106774.5-201ENST00000640558 597 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 AC233724.18-201ENST00000640803 597 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 AC233724.21-201ENST00000640846 597 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 ZNF436-AS1-201ENST00000335648 2547 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMAD3P84022 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms