Protein–RNA interactions for Protein: P80217

IFI35, Interferon-induced 35 kDa protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFI35P80217 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFI35P80217 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFI35P80217 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFI35P80217 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFI35P80217 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFI35P80217 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFI35P80217 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
IFI35P80217 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFI35P80217 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
IFI35P80217 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFI35P80217 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFI35P80217 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IFI35P80217 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFI35P80217 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFI35P80217 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFI35P80217 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFI35P80217 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFI35P80217 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFI35P80217 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFI35P80217 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFI35P80217 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFI35P80217 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFI35P80217 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFI35P80217 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFI35P80217 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFI35P80217 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFI35P80217 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFI35P80217 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFI35P80217 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
IFI35P80217 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
IFI35P80217 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFI35P80217 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFI35P80217 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFI35P80217 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFI35P80217 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFI35P80217 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFI35P80217 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFI35P80217 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
IFI35P80217 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
IFI35P80217 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFI35P80217 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFI35P80217 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFI35P80217 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFI35P80217 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFI35P80217 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
IFI35P80217 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFI35P80217 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFI35P80217 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFI35P80217 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFI35P80217 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFI35P80217 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFI35P80217 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFI35P80217 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFI35P80217 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IFI35P80217 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFI35P80217 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFI35P80217 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
IFI35P80217 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFI35P80217 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFI35P80217 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFI35P80217 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFI35P80217 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFI35P80217 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFI35P80217 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFI35P80217 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFI35P80217 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFI35P80217 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFI35P80217 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFI35P80217 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFI35P80217 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFI35P80217 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFI35P80217 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFI35P80217 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFI35P80217 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
IFI35P80217 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFI35P80217 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFI35P80217 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFI35P80217 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFI35P80217 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFI35P80217 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFI35P80217 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFI35P80217 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
IFI35P80217 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFI35P80217 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
IFI35P80217 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFI35P80217 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFI35P80217 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFI35P80217 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFI35P80217 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFI35P80217 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFI35P80217 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFI35P80217 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFI35P80217 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFI35P80217 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
IFI35P80217 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFI35P80217 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFI35P80217 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFI35P80217 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFI35P80217 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IFI35P80217 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms