Protein–RNA interactions for Protein: P43119

PTGIR, Prostacyclin receptor, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGIRP43119 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTGIRP43119 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTGIRP43119 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTGIRP43119 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTGIRP43119 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTGIRP43119 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTGIRP43119 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTGIRP43119 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTGIRP43119 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTGIRP43119 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTGIRP43119 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTGIRP43119 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTGIRP43119 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTGIRP43119 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTGIRP43119 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTGIRP43119 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PTGIRP43119 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTGIRP43119 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTGIRP43119 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTGIRP43119 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTGIRP43119 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PTGIRP43119 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTGIRP43119 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTGIRP43119 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTGIRP43119 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTGIRP43119 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTGIRP43119 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTGIRP43119 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTGIRP43119 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTGIRP43119 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTGIRP43119 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTGIRP43119 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTGIRP43119 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTGIRP43119 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTGIRP43119 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTGIRP43119 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTGIRP43119 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTGIRP43119 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTGIRP43119 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTGIRP43119 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTGIRP43119 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTGIRP43119 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTGIRP43119 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTGIRP43119 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGIRP43119 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGIRP43119 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGIRP43119 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGIRP43119 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGIRP43119 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGIRP43119 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGIRP43119 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGIRP43119 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGIRP43119 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGIRP43119 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGIRP43119 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGIRP43119 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGIRP43119 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGIRP43119 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGIRP43119 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGIRP43119 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGIRP43119 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGIRP43119 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGIRP43119 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGIRP43119 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGIRP43119 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGIRP43119 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGIRP43119 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGIRP43119 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGIRP43119 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGIRP43119 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGIRP43119 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGIRP43119 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGIRP43119 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGIRP43119 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGIRP43119 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGIRP43119 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGIRP43119 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGIRP43119 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGIRP43119 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGIRP43119 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGIRP43119 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGIRP43119 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGIRP43119 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGIRP43119 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGIRP43119 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGIRP43119 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGIRP43119 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGIRP43119 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGIRP43119 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGIRP43119 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGIRP43119 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGIRP43119 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGIRP43119 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGIRP43119 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGIRP43119 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGIRP43119 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGIRP43119 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGIRP43119 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGIRP43119 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGIRP43119 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms