Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 AL135901.1-201ENST00000451812 333 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 RN7SL23P-201ENST00000484055 275 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 C3orf38-204ENST00000486971 1259 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 SLC25A21-203ENST00000555449 1023 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HOXD10P28358 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 CHTF8-204ENST00000518041 567 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 HIST2H2BF-204ENST00000545683 999 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 RN7SL357P-201ENST00000581065 298 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 PEBP1P2-201ENST00000603980 558 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD10P28358 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms