Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPRDP23468 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTPRDP23468 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms