Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 CTSV-201ENST00000259470 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 AC019109.1-201ENST00000401725 1874 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 ETNPPL-206ENST00000510706 1692 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 HERPUD1-202ENST00000344114 1388 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 SHANK2-202ENST00000357171 1373 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 AC006329.1-201ENST00000419422 705 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 C11orf97-201ENST00000542198 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 FOXN3-AS2-201ENST00000554071 1262 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 AC009065.6-201ENST00000568795 456 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 AC020904.3-201ENST00000624199 442 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
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PTPRBP23467 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
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PTPRBP23467 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 FAM227B-212ENST00000561064 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
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PTPRBP23467 FAM163B-201ENST00000356873 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 MRPL18-201ENST00000367034 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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PTPRBP23467 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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PTPRBP23467 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 IFI35-204ENST00000438323 1232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 AC138409.2-203ENST00000508395 553 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
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PTPRBP23467 ADM-203ENST00000525063 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 ACSM5-206ENST00000575584 1130 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 AC006547.3-201ENST00000600090 583 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 AC233280.19-201ENST00000633223 136 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 LINC01002-234ENST00000633808 848 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PTPRBP23467 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC13.65□□□□□ -0.23
PTPRBP23467 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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