Protein–RNA interactions for Protein: P0DO97

CCDC192, Coiled-coil domain-containing protein 192, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC192P0DO97 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
CCDC192P0DO97 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC192P0DO97 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC192P0DO97 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC192P0DO97 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC192P0DO97 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC192P0DO97 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC192P0DO97 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC192P0DO97 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC192P0DO97 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC192P0DO97 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC192P0DO97 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC192P0DO97 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC192P0DO97 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC192P0DO97 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC192P0DO97 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC192P0DO97 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC192P0DO97 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC192P0DO97 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC192P0DO97 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC192P0DO97 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC192P0DO97 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC192P0DO97 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC192P0DO97 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC192P0DO97 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC192P0DO97 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC192P0DO97 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC192P0DO97 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC192P0DO97 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC192P0DO97 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC192P0DO97 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC192P0DO97 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC192P0DO97 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC192P0DO97 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC192P0DO97 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC192P0DO97 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC192P0DO97 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC192P0DO97 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC192P0DO97 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC192P0DO97 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC192P0DO97 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC192P0DO97 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC192P0DO97 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC192P0DO97 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC192P0DO97 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC192P0DO97 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC192P0DO97 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC192P0DO97 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC192P0DO97 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC192P0DO97 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC192P0DO97 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC192P0DO97 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC192P0DO97 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC192P0DO97 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC192P0DO97 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC192P0DO97 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC192P0DO97 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC192P0DO97 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC192P0DO97 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC192P0DO97 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC192P0DO97 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC192P0DO97 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC192P0DO97 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC192P0DO97 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC192P0DO97 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC192P0DO97 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC192P0DO97 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC192P0DO97 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC192P0DO97 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC192P0DO97 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC192P0DO97 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC192P0DO97 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC192P0DO97 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC192P0DO97 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC192P0DO97 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC192P0DO97 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC192P0DO97 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC192P0DO97 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC192P0DO97 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC192P0DO97 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC192P0DO97 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC192P0DO97 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC192P0DO97 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC192P0DO97 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC192P0DO97 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC192P0DO97 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC192P0DO97 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC192P0DO97 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC192P0DO97 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC192P0DO97 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC192P0DO97 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC192P0DO97 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC192P0DO97 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC192P0DO97 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC192P0DO97 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC192P0DO97 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC192P0DO97 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms