Protein–RNA interactions for Protein: O43586

PSTPIP1, Proline-serine-threonine phosphatase-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSTPIP1O43586 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSTPIP1O43586 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSTPIP1O43586 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSTPIP1O43586 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSTPIP1O43586 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSTPIP1O43586 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PSTPIP1O43586 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PSTPIP1O43586 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSTPIP1O43586 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSTPIP1O43586 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PSTPIP1O43586 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PSTPIP1O43586 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PSTPIP1O43586 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSTPIP1O43586 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PSTPIP1O43586 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PSTPIP1O43586 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSTPIP1O43586 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSTPIP1O43586 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PSTPIP1O43586 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSTPIP1O43586 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSTPIP1O43586 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSTPIP1O43586 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSTPIP1O43586 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PSTPIP1O43586 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSTPIP1O43586 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSTPIP1O43586 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSTPIP1O43586 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSTPIP1O43586 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSTPIP1O43586 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSTPIP1O43586 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSTPIP1O43586 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSTPIP1O43586 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PSTPIP1O43586 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSTPIP1O43586 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSTPIP1O43586 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSTPIP1O43586 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSTPIP1O43586 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSTPIP1O43586 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSTPIP1O43586 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSTPIP1O43586 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSTPIP1O43586 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSTPIP1O43586 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSTPIP1O43586 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSTPIP1O43586 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSTPIP1O43586 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSTPIP1O43586 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSTPIP1O43586 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSTPIP1O43586 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSTPIP1O43586 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PSTPIP1O43586 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PSTPIP1O43586 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSTPIP1O43586 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PSTPIP1O43586 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSTPIP1O43586 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSTPIP1O43586 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSTPIP1O43586 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSTPIP1O43586 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PSTPIP1O43586 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSTPIP1O43586 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSTPIP1O43586 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSTPIP1O43586 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSTPIP1O43586 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSTPIP1O43586 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSTPIP1O43586 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSTPIP1O43586 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSTPIP1O43586 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSTPIP1O43586 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSTPIP1O43586 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSTPIP1O43586 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSTPIP1O43586 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSTPIP1O43586 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSTPIP1O43586 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PSTPIP1O43586 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PSTPIP1O43586 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PSTPIP1O43586 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSTPIP1O43586 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSTPIP1O43586 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSTPIP1O43586 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSTPIP1O43586 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSTPIP1O43586 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSTPIP1O43586 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSTPIP1O43586 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSTPIP1O43586 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSTPIP1O43586 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSTPIP1O43586 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSTPIP1O43586 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSTPIP1O43586 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSTPIP1O43586 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PSTPIP1O43586 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSTPIP1O43586 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PSTPIP1O43586 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSTPIP1O43586 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSTPIP1O43586 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSTPIP1O43586 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSTPIP1O43586 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PSTPIP1O43586 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSTPIP1O43586 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSTPIP1O43586 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSTPIP1O43586 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSTPIP1O43586 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms