Protein–RNA interactions for Protein: R4GMW8

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIVM-ERCC5R4GMW8 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 ID2-AS1-201ENST00000412712 953 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAHD2CP-203ENST00000467292 965 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 RN7SL23P-201ENST00000484055 275 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 USB1-205ENST00000561743 1135 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC003043.1-201ENST00000588260 337 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC011247.3-201ENST00000603297 438 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC079325.2-201ENST00000641710 606 ntAPPRIS P5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL672207.1-201ENST00000328462 1570 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 DNMT3L-204ENST00000628202 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC006529.1-201ENST00000459978 637 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 ROPN1B-203ENST00000505382 713 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 MRPL49-209ENST00000534078 518 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 MT2A-202ENST00000561491 581 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC011451.3-201ENST00000634951 582 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BIVM-ERCC5R4GMW8 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC004973.1-201ENST00000413240 635 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 EEF1DP2-201ENST00000433698 843 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC134312.2-201ENST00000563521 608 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 COX5A-205ENST00000568517 582 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL451007.2-201ENST00000632004 563 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC117503.4-201ENST00000623229 1418 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC01022-201ENST00000415652 394 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 CCDC113-206ENST00000616795 891 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 TPM4-202ENST00000344824 1417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 TCEA3-201ENST00000374601 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 RPL35P9-201ENST00000446059 350 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC024293.1-201ENST00000467930 498 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZSCAN2-208ENST00000485222 910 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 AREG-202ENST00000502307 956 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC106047.2-201ENST00000511723 743 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 CHTF8-204ENST00000518041 567 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZSCAN2-210ENST00000538076 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BIVM-ERCC5R4GMW8 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
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