Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH7

SNX6, Sorting nexin-6, humanhuman

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX6Q9UNH7 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SNX6Q9UNH7 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SNX6Q9UNH7 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SNX6Q9UNH7 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SNX6Q9UNH7 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SNX6Q9UNH7 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SNX6Q9UNH7 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SNX6Q9UNH7 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SNX6Q9UNH7 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SNX6Q9UNH7 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SNX6Q9UNH7 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SNX6Q9UNH7 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SNX6Q9UNH7 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SNX6Q9UNH7 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SNX6Q9UNH7 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SNX6Q9UNH7 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SNX6Q9UNH7 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SNX6Q9UNH7 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SNX6Q9UNH7 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SNX6Q9UNH7 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SNX6Q9UNH7 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SNX6Q9UNH7 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SNX6Q9UNH7 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SNX6Q9UNH7 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SNX6Q9UNH7 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SNX6Q9UNH7 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SNX6Q9UNH7 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SNX6Q9UNH7 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SNX6Q9UNH7 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SNX6Q9UNH7 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SNX6Q9UNH7 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SNX6Q9UNH7 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SNX6Q9UNH7 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SNX6Q9UNH7 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SNX6Q9UNH7 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SNX6Q9UNH7 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SNX6Q9UNH7 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SNX6Q9UNH7 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SNX6Q9UNH7 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SNX6Q9UNH7 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SNX6Q9UNH7 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SNX6Q9UNH7 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SNX6Q9UNH7 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SNX6Q9UNH7 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SNX6Q9UNH7 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SNX6Q9UNH7 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SNX6Q9UNH7 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SNX6Q9UNH7 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SNX6Q9UNH7 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SNX6Q9UNH7 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SNX6Q9UNH7 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SNX6Q9UNH7 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SNX6Q9UNH7 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SNX6Q9UNH7 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SNX6Q9UNH7 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SNX6Q9UNH7 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SNX6Q9UNH7 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SNX6Q9UNH7 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SNX6Q9UNH7 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SNX6Q9UNH7 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SNX6Q9UNH7 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SNX6Q9UNH7 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SNX6Q9UNH7 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SNX6Q9UNH7 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SNX6Q9UNH7 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SNX6Q9UNH7 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SNX6Q9UNH7 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SNX6Q9UNH7 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SNX6Q9UNH7 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SNX6Q9UNH7 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SNX6Q9UNH7 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SNX6Q9UNH7 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SNX6Q9UNH7 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SNX6Q9UNH7 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SNX6Q9UNH7 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SNX6Q9UNH7 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SNX6Q9UNH7 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SNX6Q9UNH7 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SNX6Q9UNH7 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SNX6Q9UNH7 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SNX6Q9UNH7 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SNX6Q9UNH7 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SNX6Q9UNH7 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SNX6Q9UNH7 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SNX6Q9UNH7 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SNX6Q9UNH7 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SNX6Q9UNH7 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SNX6Q9UNH7 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SNX6Q9UNH7 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SNX6Q9UNH7 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SNX6Q9UNH7 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SNX6Q9UNH7 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SNX6Q9UNH7 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SNX6Q9UNH7 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SNX6Q9UNH7 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SNX6Q9UNH7 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SNX6Q9UNH7 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SNX6Q9UNH7 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SNX6Q9UNH7 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SNX6Q9UNH7 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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