Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT0

TTC7A, Tetratricopeptide repeat protein 7A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 858 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC7AQ9ULT0 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
TTC7AQ9ULT0 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TTC7AQ9ULT0 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TTC7AQ9ULT0 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TTC7AQ9ULT0 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
TTC7AQ9ULT0 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TTC7AQ9ULT0 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TTC7AQ9ULT0 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TTC7AQ9ULT0 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TTC7AQ9ULT0 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TTC7AQ9ULT0 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TTC7AQ9ULT0 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TTC7AQ9ULT0 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TTC7AQ9ULT0 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TTC7AQ9ULT0 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TTC7AQ9ULT0 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TTC7AQ9ULT0 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TTC7AQ9ULT0 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TTC7AQ9ULT0 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TTC7AQ9ULT0 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TTC7AQ9ULT0 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TTC7AQ9ULT0 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TTC7AQ9ULT0 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TTC7AQ9ULT0 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TTC7AQ9ULT0 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TTC7AQ9ULT0 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TTC7AQ9ULT0 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TTC7AQ9ULT0 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TTC7AQ9ULT0 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TTC7AQ9ULT0 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TTC7AQ9ULT0 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TTC7AQ9ULT0 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TTC7AQ9ULT0 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TTC7AQ9ULT0 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TTC7AQ9ULT0 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TTC7AQ9ULT0 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TTC7AQ9ULT0 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TTC7AQ9ULT0 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TTC7AQ9ULT0 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TTC7AQ9ULT0 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TTC7AQ9ULT0 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TTC7AQ9ULT0 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TTC7AQ9ULT0 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TTC7AQ9ULT0 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TTC7AQ9ULT0 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TTC7AQ9ULT0 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TTC7AQ9ULT0 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TTC7AQ9ULT0 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
TTC7AQ9ULT0 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TTC7AQ9ULT0 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TTC7AQ9ULT0 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TTC7AQ9ULT0 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TTC7AQ9ULT0 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TTC7AQ9ULT0 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TTC7AQ9ULT0 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TTC7AQ9ULT0 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TTC7AQ9ULT0 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TTC7AQ9ULT0 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TTC7AQ9ULT0 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TTC7AQ9ULT0 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TTC7AQ9ULT0 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TTC7AQ9ULT0 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
TTC7AQ9ULT0 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TTC7AQ9ULT0 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TTC7AQ9ULT0 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TTC7AQ9ULT0 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TTC7AQ9ULT0 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TTC7AQ9ULT0 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TTC7AQ9ULT0 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TTC7AQ9ULT0 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TTC7AQ9ULT0 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TTC7AQ9ULT0 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TTC7AQ9ULT0 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TTC7AQ9ULT0 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TTC7AQ9ULT0 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
TTC7AQ9ULT0 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TTC7AQ9ULT0 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TTC7AQ9ULT0 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TTC7AQ9ULT0 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TTC7AQ9ULT0 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TTC7AQ9ULT0 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TTC7AQ9ULT0 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TTC7AQ9ULT0 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
TTC7AQ9ULT0 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TTC7AQ9ULT0 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TTC7AQ9ULT0 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TTC7AQ9ULT0 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
TTC7AQ9ULT0 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
TTC7AQ9ULT0 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
TTC7AQ9ULT0 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TTC7AQ9ULT0 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TTC7AQ9ULT0 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TTC7AQ9ULT0 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
TTC7AQ9ULT0 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TTC7AQ9ULT0 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TTC7AQ9ULT0 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TTC7AQ9ULT0 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TTC7AQ9ULT0 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TTC7AQ9ULT0 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TTC7AQ9ULT0 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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