Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDY4

DNAJB4, DnaJ homolog subfamily B member 4, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJB4Q9UDY4 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNAJB4Q9UDY4 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNAJB4Q9UDY4 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
DNAJB4Q9UDY4 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNAJB4Q9UDY4 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNAJB4Q9UDY4 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNAJB4Q9UDY4 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNAJB4Q9UDY4 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNAJB4Q9UDY4 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
DNAJB4Q9UDY4 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNAJB4Q9UDY4 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNAJB4Q9UDY4 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNAJB4Q9UDY4 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNAJB4Q9UDY4 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNAJB4Q9UDY4 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNAJB4Q9UDY4 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DNAJB4Q9UDY4 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DNAJB4Q9UDY4 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DNAJB4Q9UDY4 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DNAJB4Q9UDY4 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DNAJB4Q9UDY4 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DNAJB4Q9UDY4 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DNAJB4Q9UDY4 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DNAJB4Q9UDY4 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DNAJB4Q9UDY4 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DNAJB4Q9UDY4 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DNAJB4Q9UDY4 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DNAJB4Q9UDY4 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DNAJB4Q9UDY4 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DNAJB4Q9UDY4 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DNAJB4Q9UDY4 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DNAJB4Q9UDY4 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DNAJB4Q9UDY4 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DNAJB4Q9UDY4 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DNAJB4Q9UDY4 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DNAJB4Q9UDY4 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DNAJB4Q9UDY4 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DNAJB4Q9UDY4 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DNAJB4Q9UDY4 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DNAJB4Q9UDY4 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DNAJB4Q9UDY4 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DNAJB4Q9UDY4 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
DNAJB4Q9UDY4 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DNAJB4Q9UDY4 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DNAJB4Q9UDY4 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DNAJB4Q9UDY4 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DNAJB4Q9UDY4 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DNAJB4Q9UDY4 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
DNAJB4Q9UDY4 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DNAJB4Q9UDY4 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DNAJB4Q9UDY4 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DNAJB4Q9UDY4 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DNAJB4Q9UDY4 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DNAJB4Q9UDY4 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DNAJB4Q9UDY4 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
DNAJB4Q9UDY4 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DNAJB4Q9UDY4 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DNAJB4Q9UDY4 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DNAJB4Q9UDY4 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DNAJB4Q9UDY4 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DNAJB4Q9UDY4 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DNAJB4Q9UDY4 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DNAJB4Q9UDY4 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DNAJB4Q9UDY4 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DNAJB4Q9UDY4 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DNAJB4Q9UDY4 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DNAJB4Q9UDY4 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DNAJB4Q9UDY4 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DNAJB4Q9UDY4 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DNAJB4Q9UDY4 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DNAJB4Q9UDY4 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DNAJB4Q9UDY4 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
DNAJB4Q9UDY4 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DNAJB4Q9UDY4 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DNAJB4Q9UDY4 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DNAJB4Q9UDY4 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DNAJB4Q9UDY4 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DNAJB4Q9UDY4 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DNAJB4Q9UDY4 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DNAJB4Q9UDY4 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DNAJB4Q9UDY4 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DNAJB4Q9UDY4 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DNAJB4Q9UDY4 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DNAJB4Q9UDY4 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DNAJB4Q9UDY4 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DNAJB4Q9UDY4 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DNAJB4Q9UDY4 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DNAJB4Q9UDY4 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DNAJB4Q9UDY4 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DNAJB4Q9UDY4 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DNAJB4Q9UDY4 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DNAJB4Q9UDY4 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
DNAJB4Q9UDY4 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DNAJB4Q9UDY4 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
DNAJB4Q9UDY4 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DNAJB4Q9UDY4 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DNAJB4Q9UDY4 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DNAJB4Q9UDY4 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DNAJB4Q9UDY4 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DNAJB4Q9UDY4 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms