Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVM6

DNAJC17, DnaJ homolog subfamily C member 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC17Q9NVM6 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DNAJC17Q9NVM6 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DNAJC17Q9NVM6 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DNAJC17Q9NVM6 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DNAJC17Q9NVM6 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DNAJC17Q9NVM6 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DNAJC17Q9NVM6 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DNAJC17Q9NVM6 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DNAJC17Q9NVM6 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DNAJC17Q9NVM6 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DNAJC17Q9NVM6 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
DNAJC17Q9NVM6 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DNAJC17Q9NVM6 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DNAJC17Q9NVM6 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DNAJC17Q9NVM6 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DNAJC17Q9NVM6 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DNAJC17Q9NVM6 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DNAJC17Q9NVM6 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DNAJC17Q9NVM6 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DNAJC17Q9NVM6 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DNAJC17Q9NVM6 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DNAJC17Q9NVM6 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DNAJC17Q9NVM6 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DNAJC17Q9NVM6 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DNAJC17Q9NVM6 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DNAJC17Q9NVM6 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DNAJC17Q9NVM6 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DNAJC17Q9NVM6 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DNAJC17Q9NVM6 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DNAJC17Q9NVM6 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DNAJC17Q9NVM6 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DNAJC17Q9NVM6 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DNAJC17Q9NVM6 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DNAJC17Q9NVM6 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DNAJC17Q9NVM6 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DNAJC17Q9NVM6 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DNAJC17Q9NVM6 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DNAJC17Q9NVM6 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DNAJC17Q9NVM6 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DNAJC17Q9NVM6 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DNAJC17Q9NVM6 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DNAJC17Q9NVM6 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
DNAJC17Q9NVM6 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DNAJC17Q9NVM6 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
DNAJC17Q9NVM6 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
DNAJC17Q9NVM6 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
DNAJC17Q9NVM6 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DNAJC17Q9NVM6 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DNAJC17Q9NVM6 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DNAJC17Q9NVM6 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DNAJC17Q9NVM6 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
DNAJC17Q9NVM6 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DNAJC17Q9NVM6 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DNAJC17Q9NVM6 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DNAJC17Q9NVM6 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DNAJC17Q9NVM6 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DNAJC17Q9NVM6 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DNAJC17Q9NVM6 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DNAJC17Q9NVM6 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DNAJC17Q9NVM6 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DNAJC17Q9NVM6 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DNAJC17Q9NVM6 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DNAJC17Q9NVM6 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DNAJC17Q9NVM6 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DNAJC17Q9NVM6 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DNAJC17Q9NVM6 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DNAJC17Q9NVM6 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DNAJC17Q9NVM6 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DNAJC17Q9NVM6 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
DNAJC17Q9NVM6 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DNAJC17Q9NVM6 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DNAJC17Q9NVM6 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DNAJC17Q9NVM6 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DNAJC17Q9NVM6 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DNAJC17Q9NVM6 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DNAJC17Q9NVM6 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DNAJC17Q9NVM6 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DNAJC17Q9NVM6 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DNAJC17Q9NVM6 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DNAJC17Q9NVM6 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DNAJC17Q9NVM6 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DNAJC17Q9NVM6 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DNAJC17Q9NVM6 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DNAJC17Q9NVM6 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DNAJC17Q9NVM6 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DNAJC17Q9NVM6 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DNAJC17Q9NVM6 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DNAJC17Q9NVM6 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DNAJC17Q9NVM6 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
DNAJC17Q9NVM6 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DNAJC17Q9NVM6 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
DNAJC17Q9NVM6 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DNAJC17Q9NVM6 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DNAJC17Q9NVM6 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
DNAJC17Q9NVM6 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DNAJC17Q9NVM6 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DNAJC17Q9NVM6 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
DNAJC17Q9NVM6 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
DNAJC17Q9NVM6 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DNAJC17Q9NVM6 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 296.6 ms