Protein–RNA interactions for Protein: Q9HA38

ZMAT3, Zinc finger matrin-type protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZMAT3Q9HA38 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ZMAT3Q9HA38 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ZMAT3Q9HA38 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ZMAT3Q9HA38 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ZMAT3Q9HA38 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ZMAT3Q9HA38 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ZMAT3Q9HA38 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ZMAT3Q9HA38 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
ZMAT3Q9HA38 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ZMAT3Q9HA38 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ZMAT3Q9HA38 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ZMAT3Q9HA38 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ZMAT3Q9HA38 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ZMAT3Q9HA38 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ZMAT3Q9HA38 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ZMAT3Q9HA38 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ZMAT3Q9HA38 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ZMAT3Q9HA38 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ZMAT3Q9HA38 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ZMAT3Q9HA38 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ZMAT3Q9HA38 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZMAT3Q9HA38 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZMAT3Q9HA38 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZMAT3Q9HA38 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZMAT3Q9HA38 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZMAT3Q9HA38 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZMAT3Q9HA38 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
ZMAT3Q9HA38 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZMAT3Q9HA38 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZMAT3Q9HA38 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZMAT3Q9HA38 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZMAT3Q9HA38 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZMAT3Q9HA38 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZMAT3Q9HA38 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZMAT3Q9HA38 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZMAT3Q9HA38 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZMAT3Q9HA38 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZMAT3Q9HA38 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZMAT3Q9HA38 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZMAT3Q9HA38 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZMAT3Q9HA38 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZMAT3Q9HA38 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZMAT3Q9HA38 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZMAT3Q9HA38 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZMAT3Q9HA38 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZMAT3Q9HA38 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZMAT3Q9HA38 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZMAT3Q9HA38 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZMAT3Q9HA38 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
ZMAT3Q9HA38 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZMAT3Q9HA38 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZMAT3Q9HA38 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZMAT3Q9HA38 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZMAT3Q9HA38 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZMAT3Q9HA38 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZMAT3Q9HA38 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
ZMAT3Q9HA38 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZMAT3Q9HA38 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZMAT3Q9HA38 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZMAT3Q9HA38 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZMAT3Q9HA38 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZMAT3Q9HA38 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZMAT3Q9HA38 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZMAT3Q9HA38 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZMAT3Q9HA38 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ZMAT3Q9HA38 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
ZMAT3Q9HA38 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
ZMAT3Q9HA38 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
ZMAT3Q9HA38 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
ZMAT3Q9HA38 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
ZMAT3Q9HA38 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZMAT3Q9HA38 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZMAT3Q9HA38 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZMAT3Q9HA38 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZMAT3Q9HA38 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZMAT3Q9HA38 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZMAT3Q9HA38 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZMAT3Q9HA38 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZMAT3Q9HA38 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZMAT3Q9HA38 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZMAT3Q9HA38 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZMAT3Q9HA38 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZMAT3Q9HA38 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZMAT3Q9HA38 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZMAT3Q9HA38 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZMAT3Q9HA38 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZMAT3Q9HA38 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
ZMAT3Q9HA38 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZMAT3Q9HA38 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZMAT3Q9HA38 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZMAT3Q9HA38 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZMAT3Q9HA38 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZMAT3Q9HA38 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZMAT3Q9HA38 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZMAT3Q9HA38 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZMAT3Q9HA38 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZMAT3Q9HA38 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZMAT3Q9HA38 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
ZMAT3Q9HA38 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZMAT3Q9HA38 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms