Protein–RNA interactions for Protein: Q9C037

TRIM4, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM4Q9C037 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM4Q9C037 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM4Q9C037 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM4Q9C037 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM4Q9C037 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM4Q9C037 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM4Q9C037 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM4Q9C037 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM4Q9C037 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM4Q9C037 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM4Q9C037 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM4Q9C037 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM4Q9C037 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM4Q9C037 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM4Q9C037 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM4Q9C037 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM4Q9C037 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM4Q9C037 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM4Q9C037 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM4Q9C037 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM4Q9C037 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM4Q9C037 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM4Q9C037 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM4Q9C037 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM4Q9C037 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM4Q9C037 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM4Q9C037 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM4Q9C037 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM4Q9C037 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM4Q9C037 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM4Q9C037 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM4Q9C037 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM4Q9C037 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM4Q9C037 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM4Q9C037 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM4Q9C037 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM4Q9C037 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM4Q9C037 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM4Q9C037 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM4Q9C037 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM4Q9C037 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM4Q9C037 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM4Q9C037 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM4Q9C037 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM4Q9C037 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM4Q9C037 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM4Q9C037 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM4Q9C037 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM4Q9C037 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM4Q9C037 PROKR1-201ENST00000303786 4273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM4Q9C037 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM4Q9C037 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM4Q9C037 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM4Q9C037 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM4Q9C037 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM4Q9C037 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM4Q9C037 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM4Q9C037 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM4Q9C037 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM4Q9C037 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM4Q9C037 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM4Q9C037 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM4Q9C037 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TRIM4Q9C037 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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