Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.39■□□□□ 0.06
RTKNQ9BST9 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RTKNQ9BST9 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms