Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSI4

TINF2, TERF1-interacting nuclear factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TINF2Q9BSI4 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TINF2Q9BSI4 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TINF2Q9BSI4 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TINF2Q9BSI4 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TINF2Q9BSI4 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TINF2Q9BSI4 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TINF2Q9BSI4 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TINF2Q9BSI4 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TINF2Q9BSI4 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TINF2Q9BSI4 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TINF2Q9BSI4 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TINF2Q9BSI4 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TINF2Q9BSI4 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TINF2Q9BSI4 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TINF2Q9BSI4 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TINF2Q9BSI4 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TINF2Q9BSI4 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TINF2Q9BSI4 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TINF2Q9BSI4 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TINF2Q9BSI4 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TINF2Q9BSI4 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TINF2Q9BSI4 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TINF2Q9BSI4 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TINF2Q9BSI4 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TINF2Q9BSI4 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TINF2Q9BSI4 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TINF2Q9BSI4 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TINF2Q9BSI4 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TINF2Q9BSI4 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TINF2Q9BSI4 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TINF2Q9BSI4 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TINF2Q9BSI4 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TINF2Q9BSI4 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TINF2Q9BSI4 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TINF2Q9BSI4 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TINF2Q9BSI4 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TINF2Q9BSI4 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TINF2Q9BSI4 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TINF2Q9BSI4 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TINF2Q9BSI4 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TINF2Q9BSI4 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TINF2Q9BSI4 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TINF2Q9BSI4 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TINF2Q9BSI4 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TINF2Q9BSI4 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TINF2Q9BSI4 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TINF2Q9BSI4 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TINF2Q9BSI4 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TINF2Q9BSI4 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TINF2Q9BSI4 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TINF2Q9BSI4 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TINF2Q9BSI4 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TINF2Q9BSI4 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TINF2Q9BSI4 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TINF2Q9BSI4 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TINF2Q9BSI4 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TINF2Q9BSI4 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TINF2Q9BSI4 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TINF2Q9BSI4 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TINF2Q9BSI4 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TINF2Q9BSI4 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TINF2Q9BSI4 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TINF2Q9BSI4 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TINF2Q9BSI4 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TINF2Q9BSI4 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TINF2Q9BSI4 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TINF2Q9BSI4 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TINF2Q9BSI4 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TINF2Q9BSI4 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TINF2Q9BSI4 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TINF2Q9BSI4 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TINF2Q9BSI4 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TINF2Q9BSI4 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TINF2Q9BSI4 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TINF2Q9BSI4 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TINF2Q9BSI4 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TINF2Q9BSI4 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TINF2Q9BSI4 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TINF2Q9BSI4 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TINF2Q9BSI4 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TINF2Q9BSI4 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TINF2Q9BSI4 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TINF2Q9BSI4 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TINF2Q9BSI4 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TINF2Q9BSI4 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TINF2Q9BSI4 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TINF2Q9BSI4 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TINF2Q9BSI4 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TINF2Q9BSI4 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TINF2Q9BSI4 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TINF2Q9BSI4 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TINF2Q9BSI4 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TINF2Q9BSI4 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TINF2Q9BSI4 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TINF2Q9BSI4 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TINF2Q9BSI4 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TINF2Q9BSI4 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TINF2Q9BSI4 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TINF2Q9BSI4 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TINF2Q9BSI4 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms