Protein–RNA interactions for Protein: Q99956

DUSP9, Dual specificity protein phosphatase 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP9Q99956 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
DUSP9Q99956 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DUSP9Q99956 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.8 ms