Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SIN3AQ96ST3 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SIN3AQ96ST3 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SIN3AQ96ST3 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SIN3AQ96ST3 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SIN3AQ96ST3 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SIN3AQ96ST3 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SIN3AQ96ST3 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SIN3AQ96ST3 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SIN3AQ96ST3 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SIN3AQ96ST3 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SIN3AQ96ST3 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SIN3AQ96ST3 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SIN3AQ96ST3 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SIN3AQ96ST3 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SIN3AQ96ST3 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SIN3AQ96ST3 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SIN3AQ96ST3 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SIN3AQ96ST3 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SIN3AQ96ST3 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SIN3AQ96ST3 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SIN3AQ96ST3 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SIN3AQ96ST3 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SIN3AQ96ST3 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SIN3AQ96ST3 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SIN3AQ96ST3 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SIN3AQ96ST3 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SIN3AQ96ST3 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SIN3AQ96ST3 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SIN3AQ96ST3 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SIN3AQ96ST3 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SIN3AQ96ST3 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SIN3AQ96ST3 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SIN3AQ96ST3 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SIN3AQ96ST3 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SIN3AQ96ST3 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SIN3AQ96ST3 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SIN3AQ96ST3 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SIN3AQ96ST3 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SIN3AQ96ST3 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SIN3AQ96ST3 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SIN3AQ96ST3 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SIN3AQ96ST3 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SIN3AQ96ST3 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SIN3AQ96ST3 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SIN3AQ96ST3 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SIN3AQ96ST3 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SIN3AQ96ST3 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SIN3AQ96ST3 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SIN3AQ96ST3 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SIN3AQ96ST3 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SIN3AQ96ST3 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SIN3AQ96ST3 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SIN3AQ96ST3 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SIN3AQ96ST3 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms