Protein–RNA interactions for Protein: Q96NF6

C8orf49, Putative uncharacterized protein C8orf49, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf49Q96NF6 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
C8orf49Q96NF6 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
C8orf49Q96NF6 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
C8orf49Q96NF6 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
C8orf49Q96NF6 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C8orf49Q96NF6 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C8orf49Q96NF6 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
C8orf49Q96NF6 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C8orf49Q96NF6 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C8orf49Q96NF6 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
C8orf49Q96NF6 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C8orf49Q96NF6 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
C8orf49Q96NF6 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C8orf49Q96NF6 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C8orf49Q96NF6 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
C8orf49Q96NF6 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C8orf49Q96NF6 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C8orf49Q96NF6 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
C8orf49Q96NF6 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C8orf49Q96NF6 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C8orf49Q96NF6 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C8orf49Q96NF6 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
C8orf49Q96NF6 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
C8orf49Q96NF6 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C8orf49Q96NF6 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C8orf49Q96NF6 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
C8orf49Q96NF6 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C8orf49Q96NF6 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
C8orf49Q96NF6 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C8orf49Q96NF6 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
C8orf49Q96NF6 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
C8orf49Q96NF6 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
C8orf49Q96NF6 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
C8orf49Q96NF6 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
C8orf49Q96NF6 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
C8orf49Q96NF6 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
C8orf49Q96NF6 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
C8orf49Q96NF6 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
C8orf49Q96NF6 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C8orf49Q96NF6 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C8orf49Q96NF6 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C8orf49Q96NF6 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C8orf49Q96NF6 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C8orf49Q96NF6 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C8orf49Q96NF6 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C8orf49Q96NF6 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C8orf49Q96NF6 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
C8orf49Q96NF6 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
C8orf49Q96NF6 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
C8orf49Q96NF6 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
C8orf49Q96NF6 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
C8orf49Q96NF6 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C8orf49Q96NF6 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
C8orf49Q96NF6 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
C8orf49Q96NF6 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C8orf49Q96NF6 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C8orf49Q96NF6 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C8orf49Q96NF6 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
C8orf49Q96NF6 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C8orf49Q96NF6 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C8orf49Q96NF6 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C8orf49Q96NF6 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C8orf49Q96NF6 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
C8orf49Q96NF6 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C8orf49Q96NF6 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
C8orf49Q96NF6 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C8orf49Q96NF6 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
C8orf49Q96NF6 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C8orf49Q96NF6 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C8orf49Q96NF6 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
C8orf49Q96NF6 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C8orf49Q96NF6 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
C8orf49Q96NF6 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
C8orf49Q96NF6 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
C8orf49Q96NF6 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
C8orf49Q96NF6 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
C8orf49Q96NF6 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
C8orf49Q96NF6 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
C8orf49Q96NF6 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
C8orf49Q96NF6 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
C8orf49Q96NF6 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
C8orf49Q96NF6 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
C8orf49Q96NF6 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
C8orf49Q96NF6 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
C8orf49Q96NF6 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
C8orf49Q96NF6 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
C8orf49Q96NF6 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
C8orf49Q96NF6 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
C8orf49Q96NF6 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
C8orf49Q96NF6 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
C8orf49Q96NF6 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
C8orf49Q96NF6 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
C8orf49Q96NF6 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
C8orf49Q96NF6 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
C8orf49Q96NF6 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
C8orf49Q96NF6 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
C8orf49Q96NF6 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
C8orf49Q96NF6 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
C8orf49Q96NF6 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
C8orf49Q96NF6 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms