Protein–RNA interactions for Protein: Q96GF1

RNF185, E3 ubiquitin-protein ligase RNF185, humanhuman

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Length 192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF185Q96GF1 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
RNF185Q96GF1 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
RNF185Q96GF1 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
RNF185Q96GF1 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
RNF185Q96GF1 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC10.89□□□□□ -0.67
RNF185Q96GF1 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
RNF185Q96GF1 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
RNF185Q96GF1 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
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RNF185Q96GF1 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
RNF185Q96GF1 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
RNF185Q96GF1 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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RNF185Q96GF1 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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RNF185Q96GF1 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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RNF185Q96GF1 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
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RNF185Q96GF1 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
RNF185Q96GF1 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
RNF185Q96GF1 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
RNF185Q96GF1 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
RNF185Q96GF1 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
RNF185Q96GF1 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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