Protein–RNA interactions for Protein: Q7L099

RUFY3, Protein RUFY3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY3Q7L099 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RUFY3Q7L099 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RUFY3Q7L099 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RUFY3Q7L099 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RUFY3Q7L099 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RUFY3Q7L099 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RUFY3Q7L099 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RUFY3Q7L099 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
RUFY3Q7L099 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
RUFY3Q7L099 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RUFY3Q7L099 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RUFY3Q7L099 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RUFY3Q7L099 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RUFY3Q7L099 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RUFY3Q7L099 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RUFY3Q7L099 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RUFY3Q7L099 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RUFY3Q7L099 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RUFY3Q7L099 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RUFY3Q7L099 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RUFY3Q7L099 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RUFY3Q7L099 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RUFY3Q7L099 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RUFY3Q7L099 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RUFY3Q7L099 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
RUFY3Q7L099 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RUFY3Q7L099 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RUFY3Q7L099 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RUFY3Q7L099 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RUFY3Q7L099 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RUFY3Q7L099 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RUFY3Q7L099 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RUFY3Q7L099 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RUFY3Q7L099 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RUFY3Q7L099 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RUFY3Q7L099 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
RUFY3Q7L099 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RUFY3Q7L099 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RUFY3Q7L099 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RUFY3Q7L099 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RUFY3Q7L099 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RUFY3Q7L099 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RUFY3Q7L099 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RUFY3Q7L099 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RUFY3Q7L099 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RUFY3Q7L099 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RUFY3Q7L099 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RUFY3Q7L099 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RUFY3Q7L099 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RUFY3Q7L099 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RUFY3Q7L099 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RUFY3Q7L099 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RUFY3Q7L099 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RUFY3Q7L099 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RUFY3Q7L099 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RUFY3Q7L099 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RUFY3Q7L099 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RUFY3Q7L099 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RUFY3Q7L099 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
RUFY3Q7L099 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RUFY3Q7L099 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
RUFY3Q7L099 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RUFY3Q7L099 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RUFY3Q7L099 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RUFY3Q7L099 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RUFY3Q7L099 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RUFY3Q7L099 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RUFY3Q7L099 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RUFY3Q7L099 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RUFY3Q7L099 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RUFY3Q7L099 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RUFY3Q7L099 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RUFY3Q7L099 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RUFY3Q7L099 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RUFY3Q7L099 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
RUFY3Q7L099 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RUFY3Q7L099 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RUFY3Q7L099 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RUFY3Q7L099 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RUFY3Q7L099 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RUFY3Q7L099 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RUFY3Q7L099 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RUFY3Q7L099 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RUFY3Q7L099 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RUFY3Q7L099 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RUFY3Q7L099 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RUFY3Q7L099 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RUFY3Q7L099 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RUFY3Q7L099 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
RUFY3Q7L099 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
RUFY3Q7L099 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RUFY3Q7L099 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
RUFY3Q7L099 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RUFY3Q7L099 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RUFY3Q7L099 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RUFY3Q7L099 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RUFY3Q7L099 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RUFY3Q7L099 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RUFY3Q7L099 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RUFY3Q7L099 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms