Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4E1

CASC4, Protein CASC4, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC4Q6P4E1 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASC4Q6P4E1 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms