Protein–RNA interactions for Protein: Q6DD88

ATL3, Atlastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL3Q6DD88 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATL3Q6DD88 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATL3Q6DD88 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATL3Q6DD88 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATL3Q6DD88 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATL3Q6DD88 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATL3Q6DD88 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATL3Q6DD88 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATL3Q6DD88 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATL3Q6DD88 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATL3Q6DD88 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATL3Q6DD88 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATL3Q6DD88 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATL3Q6DD88 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATL3Q6DD88 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATL3Q6DD88 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATL3Q6DD88 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATL3Q6DD88 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATL3Q6DD88 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATL3Q6DD88 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ATL3Q6DD88 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ATL3Q6DD88 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATL3Q6DD88 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATL3Q6DD88 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATL3Q6DD88 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATL3Q6DD88 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATL3Q6DD88 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATL3Q6DD88 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATL3Q6DD88 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATL3Q6DD88 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ATL3Q6DD88 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ATL3Q6DD88 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATL3Q6DD88 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATL3Q6DD88 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATL3Q6DD88 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATL3Q6DD88 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATL3Q6DD88 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATL3Q6DD88 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATL3Q6DD88 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATL3Q6DD88 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATL3Q6DD88 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATL3Q6DD88 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ATL3Q6DD88 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATL3Q6DD88 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATL3Q6DD88 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATL3Q6DD88 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATL3Q6DD88 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATL3Q6DD88 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATL3Q6DD88 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATL3Q6DD88 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATL3Q6DD88 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATL3Q6DD88 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATL3Q6DD88 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATL3Q6DD88 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATL3Q6DD88 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATL3Q6DD88 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATL3Q6DD88 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATL3Q6DD88 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATL3Q6DD88 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATL3Q6DD88 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ATL3Q6DD88 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATL3Q6DD88 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATL3Q6DD88 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATL3Q6DD88 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATL3Q6DD88 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATL3Q6DD88 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATL3Q6DD88 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATL3Q6DD88 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATL3Q6DD88 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATL3Q6DD88 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATL3Q6DD88 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ATL3Q6DD88 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATL3Q6DD88 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATL3Q6DD88 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATL3Q6DD88 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATL3Q6DD88 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATL3Q6DD88 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATL3Q6DD88 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATL3Q6DD88 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATL3Q6DD88 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATL3Q6DD88 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATL3Q6DD88 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATL3Q6DD88 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATL3Q6DD88 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATL3Q6DD88 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATL3Q6DD88 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATL3Q6DD88 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATL3Q6DD88 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATL3Q6DD88 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATL3Q6DD88 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATL3Q6DD88 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATL3Q6DD88 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATL3Q6DD88 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATL3Q6DD88 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATL3Q6DD88 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATL3Q6DD88 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATL3Q6DD88 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATL3Q6DD88 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATL3Q6DD88 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATL3Q6DD88 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms