Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT33

LINC01545, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01545, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01545Q5VT33 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC01545Q5VT33 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC01545Q5VT33 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC01545Q5VT33 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC01545Q5VT33 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC01545Q5VT33 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC01545Q5VT33 CTCFL-208ENST00000432255 2955 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC01545Q5VT33 WDFY1-201ENST00000233055 4660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC01545Q5VT33 GUCY1B3-204ENST00000505154 2316 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC01545Q5VT33 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC01545Q5VT33 PLA2G6-202ENST00000335539 3060 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC01545Q5VT33 RBM15-203ENST00000602849 3368 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC01545Q5VT33 LPCAT1-201ENST00000283415 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC01545Q5VT33 POPDC2-201ENST00000264231 1679 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC01545Q5VT33 TXLNA-201ENST00000373609 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC01545Q5VT33 STRCP1-201ENST00000509801 5328 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC01545Q5VT33 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC01545Q5VT33 PDE2A-203ENST00000418754 2855 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC01545Q5VT33 TBC1D22B-201ENST00000373491 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC01545Q5VT33 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC01545Q5VT33 TRPC7-201ENST00000352189 2241 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC01545Q5VT33 SFTPA1-202ENST00000419470 2210 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC01545Q5VT33 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC01545Q5VT33 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC01545Q5VT33 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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LINC01545Q5VT33 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC01545Q5VT33 ATG4C-201ENST00000317868 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC01545Q5VT33 CCNI-201ENST00000237654 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC01545Q5VT33 BTRC-202ENST00000370187 6134 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC01545Q5VT33 FAM118A-201ENST00000216214 3458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC01545Q5VT33 SLC35F2-203ENST00000525071 3331 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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LINC01545Q5VT33 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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LINC01545Q5VT33 CTTN-201ENST00000301843 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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LINC01545Q5VT33 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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LINC01545Q5VT33 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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LINC01545Q5VT33 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC01545Q5VT33 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC01545Q5VT33 ABCF3-201ENST00000292808 2453 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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LINC01545Q5VT33 AC144450.1-201ENST00000366424 1641 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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LINC01545Q5VT33 OCRL-201ENST00000357121 5138 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC01545Q5VT33 CCDC144NL-201ENST00000327925 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC01545Q5VT33 CACNA1C-231ENST00000616390 2833 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC01545Q5VT33 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC01545Q5VT33 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC01545Q5VT33 PIP5K1A-204ENST00000409426 3737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LINC01545Q5VT33 FAM212B-AS1-201ENST00000430373 2131 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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LINC01545Q5VT33 CARS-214ENST00000529772 2637 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
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