Protein–RNA interactions for Protein: Q5TDP6

LGSN, Lengsin, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGSNQ5TDP6 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 ALX4-201ENST00000329255 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 JMJD6-203ENST00000445478 5303 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 ARAP1-201ENST00000334211 4942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 OAS3-201ENST00000228928 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LGSNQ5TDP6 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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