Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms