Protein–RNA interactions for Protein: Q53H82

LACTB2, Endoribonuclease LACTB2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LACTB2Q53H82 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 BEND3P3-201ENST00000611030 2440 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 CDC45-205ENST00000437685 2072 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 CYB5D1-203ENST00000571846 1870 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LACTB2Q53H82 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LACTB2Q53H82 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
LACTB2Q53H82 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LACTB2Q53H82 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
LACTB2Q53H82 LPO-201ENST00000262290 2979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LACTB2Q53H82 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LACTB2Q53H82 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LACTB2Q53H82 PGAM1P5-202ENST00000552554 2148 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms