Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC38Q502W7 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms