Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
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ECM1Q16610 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
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ECM1Q16610 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
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ECM1Q16610 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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ECM1Q16610 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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ECM1Q16610 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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ECM1Q16610 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ECM1Q16610 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
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ECM1Q16610 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
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ECM1Q16610 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ECM1Q16610 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
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