Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBE3CQ15386 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
UBE3CQ15386 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
UBE3CQ15386 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
UBE3CQ15386 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBE3CQ15386 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBE3CQ15386 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBE3CQ15386 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBE3CQ15386 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBE3CQ15386 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBE3CQ15386 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBE3CQ15386 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBE3CQ15386 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBE3CQ15386 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBE3CQ15386 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBE3CQ15386 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBE3CQ15386 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBE3CQ15386 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
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UBE3CQ15386 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBE3CQ15386 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBE3CQ15386 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBE3CQ15386 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBE3CQ15386 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBE3CQ15386 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
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UBE3CQ15386 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
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UBE3CQ15386 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
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UBE3CQ15386 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBE3CQ15386 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBE3CQ15386 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
UBE3CQ15386 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
UBE3CQ15386 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
UBE3CQ15386 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBE3CQ15386 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBE3CQ15386 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBE3CQ15386 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBE3CQ15386 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
UBE3CQ15386 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBE3CQ15386 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBE3CQ15386 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBE3CQ15386 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBE3CQ15386 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBE3CQ15386 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBE3CQ15386 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBE3CQ15386 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBE3CQ15386 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBE3CQ15386 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBE3CQ15386 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBE3CQ15386 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBE3CQ15386 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBE3CQ15386 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
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