Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 IKZF1-203ENST00000346667 5376 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 AFF2-202ENST00000342251 7313 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 RPL15-213ENST00000611050 2363 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 HYOU1-220ENST00000617285 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 SPTB-202ENST00000389720 6321 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 OTUD4-201ENST00000447906 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 POU5F2-201ENST00000606183 8418 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 ATP11A-201ENST00000375630 8768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 TMUB2-201ENST00000319511 2418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 PRR26-201ENST00000381489 7250 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 BRWD1-204ENST00000380800 7605 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 MEST-204ENST00000393187 2380 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 MYO9B-206ENST00000595618 7623 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 AP1B1-201ENST00000317368 3903 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 CAPN5-201ENST00000278559 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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SMCO1Q147U7 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
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SMCO1Q147U7 CCDC117-201ENST00000249064 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 NR3C2-203ENST00000358102 5893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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SMCO1Q147U7 ABR-202ENST00000302538 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 GSE1-203ENST00000405402 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 MNT-201ENST00000174618 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 MYO7A-205ENST00000458637 7336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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